NGS的國產(chǎn)磁珠到底怎么樣?且看國產(chǎn)品牌磁珠表現(xiàn)
目前二代測序中磁珠原料90%以上的產(chǎn)品種類依賴進口,海貍作為早期國產(chǎn)品牌磁珠廠家,將進一步加大第三代化學發(fā)光及免疫捕獲磁珠的規(guī)?;慨a(chǎn),定位全球市場,致力打造納米磁珠材料領軍品牌。
NGS的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。相比于一代測序,NGS更加省時低成本,速度快,覆蓋度深,準確度高。對于疾病引起的基因突變,NGS可以為患者醫(yī)師提供更為準確的診斷依據(jù)。目前,二代測序也是現(xiàn)階段科研市場的主力平臺,主要應用包括DNA測序、RNA測序和表觀基因研究等方面。
近年來,高通量測序技術已經(jīng)日漸成為基因組學研究項目的標準。從樣品制備到文庫制備及最終測序,大多步驟都要求精確高效化、易于自動化操作。磁珠,作為一種新型磁性納米材料,在高通量樣本處理中的應用越來越廣泛。納米磁珠適用于自動化和高通量樣本處理,例如高效提取游離血球外核酸,標記捕獲超微量及痕量生物大分子,已經(jīng)廣泛應用于唐氏篩查、腫瘤分子和免疫檢測、細胞免疫治療等領域,當前90%以上的產(chǎn)品種類依賴進口,被稱為生物醫(yī)學領域的‘芯片級’原料。
海貍作為國內(nèi)較早期從事納米磁珠技術和產(chǎn)品開發(fā)的國家級高新技術企業(yè),近10年來,專注于納米磁珠技術自主研發(fā),從第一代彌散結構納米磁珠技術,第二代核殼結構二氧化硅磁珠,到第三代多夾層結構聚合物磁珠,不斷取得技術突破,持續(xù)進行產(chǎn)業(yè)升級。
二代測序工作流程:
在NGS整個流程中,有兩款磁珠是必不可少,包括片段篩選和探針捕獲磁珠
表1. 磁珠在二代測序中的應用
行業(yè)現(xiàn)狀
片段篩選磁珠
片段篩選磁珠最早是由beckman通過SPRI磁珠技術開發(fā),近幾年國內(nèi)外稍微有了些品牌,比如Clean NA,Omeaga等。但是國產(chǎn)很少有品牌能夠跟Beckman AMpure XP 1:1替換。海貍技術團隊,采用納米材料和生物技術雙輪驅動,經(jīng)過3年多的技術開發(fā)和反復驗證,推出了DNA片段篩選磁珠,其具備:高純度,精準篩分,良好操作性能特點。在DNA建庫應用測試中,BeaverBeads? DNA Select Isolation的片段回收范圍與進口品牌相同,片段回收效率偏差<3%,可實現(xiàn)進口產(chǎn)品1:1替代。
有圖有真相,且看DNA建庫應用測試
結論:從DNA文庫中篩選300-500bp和500-700bp范圍的片段,BeaverBeads? DNA Select Isolation的片段回收范圍與進口品牌相同,片段回收效率偏差<3%,可實現(xiàn)進口產(chǎn)品1:1替代。
探針捕獲磁珠
探針捕獲磁珠,基本上使用鏈霉親和素磁珠,目前幾乎使用進口磁珠,如Dynabeads M270。國內(nèi)幾乎無替代。海貍深耕納米磁珠技術10多年,經(jīng)過三代技術革新,推出了多層結構的鏈霉親和素磁珠。其具備:低背景,高載量,粒徑均一特點。
BeaverBeads streptavidin掃描電鏡成像
有圖有真相,且看核酸探針捕獲對比測試
測試結果顯示:核酸探針結合量與進口磁珠相當,目的核酸探針捕獲效率達到進口磁珠的90%。
當前二代測序中磁珠原料90%以上的產(chǎn)品種類依賴進口,海貍作為早期國產(chǎn)品牌磁珠廠家,將進一步加大第三代化學發(fā)光及免疫捕獲磁珠的規(guī)?;慨a(chǎn),定位全球市場,致力打造納米磁珠材料領軍品牌。
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產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 訂貨號 |
鏈霉親和素磁珠(300nm) | 10 mg/mL, 300nm | 22308 |
鏈霉親和素磁珠(2.8μm) | 10 mg/mL, 2.8 μm | 22309 |
鏈霉親和素磁珠(1μm) | 10 mg/mL, 1μm | 22307 |
DNA片段篩選 | 5 mL、60 mL、60 mL | 70407 |