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應(yīng)用案例

BeaverBeads? GSH用于純化GST標(biāo)記的ZmMADS1進(jìn)行后續(xù)分析

研究過程中,采用BeaverBeads? GSH純化GST標(biāo)記的ZmMADS1進(jìn)行后續(xù)分析,發(fā)現(xiàn)SNP-1245作為順式作用元件通過影響上游基因ZmMADS1與ZCN8的結(jié)合來調(diào)控ZCN8的表達(dá)。

中國農(nóng)業(yè)大學(xué)田豐教授等在出版于Current Biology 9.251的ZCN8的順式調(diào)控變化有助于玉米開花期的適應(yīng)中得到:ZCN8是玉米中的成花素基因,是玉米開花期調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵整合因子。該研究團(tuán)隊(duì)通過關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)ZCN8啟動(dòng)子上兩個(gè)序列變異分別與花期顯著關(guān)聯(lián),證實(shí)ZCN8在調(diào)控玉米花期自然變異中發(fā)揮了重要作用。進(jìn)一步群體遺傳學(xué)分析發(fā)現(xiàn),其中的序列變異SNP-1245在祖先種大芻草中已經(jīng)存在,其早開花等位基因在玉米早期馴化中受到強(qiáng)烈選擇,導(dǎo)致大多數(shù)玉米攜帶SNP-1245的早開花等位基因。

研究過程中,采用BeaverBeadsTMGSH純化GST標(biāo)記的ZmMADS1進(jìn)行后續(xù)分析,發(fā)現(xiàn)SNP-1245作為順式作用元件通過影響上游基因ZmMADS1與ZCN8的結(jié)合來調(diào)控ZCN8的表達(dá)。在玉米向高山地區(qū)散播過程中,來自近緣祖先種(Zea mays ssp. mexicana)的另一個(gè)早開花自然變異雜交滲入進(jìn)SNP-1245早開花單倍型中,從而幫助玉米適應(yīng)溫帶環(huán)境。該研究不僅首次提出了玉米花期適應(yīng)過程中單個(gè)基因的逐步進(jìn)化機(jī)制,也揭示了近緣種的基因滲入對提高玉米適應(yīng)性的重要作用,而且進(jìn)一步構(gòu)建了玉米花期適應(yīng)的多基因進(jìn)化圖譜,這些研究結(jié)果為其他作物的馴化和適應(yīng)研究提供了重要借鑒。

 

圖 電泳遷移率變動(dòng)分析(EMSA)

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